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FreeCAD fa un ampio uso di Python. Con esso, è possibile accedere e controllare praticamente qualsiasi funzione di FreeCAD. È possibile ad esempio creare dei nuovi oggetti, modificare la loro geometria, analizzare il loro contenuto, o addirittura creare nuovi comandi, strumenti e pannelli per l'interfaccia. Alcuni ambienti di FreeCAD e la maggior parte degli ambienti addon sono completamente programmati in Python. FreeCAD ha una console Python avanzata, disponibile dal menù Visualizza->Pannelli->Console Python. Spesso è utile per eseguire operazioni per le quali non vi è ancora alcun pulsante nella barra degli strumenti, o per verificare le forme che danno problemi, o per eseguire delle operazioni ripetitive: