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最後はFreeCADの最も強力な機能の一つ、スクリプト環境です. 統合されたPythonコンソールから（あるいは他の外部のPythonスクリプトからでも）、FreeCADのほとんど全ての機能へアクセスできます. ジオメトリの作成や修正、3Dシーンでのオブジェクトの表示方法の変更、FreeCADインターフェースへのアクセスや変更が可能です. Pythonスクリプトはまたマクロとしても使用され、カスタムコマンドを簡単に作成することができます.